Il Convento di San Francesco al Deserto si trova sull’isola omonima, immersa nelle barene e nella pace della laguna. Pare che sia stato lo stesso San Francesco a scegliere l’isola come luogo per pregare e riflettere e che poi la stessa sia stata donata ai Frati minori dal proprietario, il nobile veneziano Jacopo Michiel, cinque anni dopo la canonizzazione del frate di Assisi.

In uno dei due chiostri è presente un altro luogo caro ai frati: un pozzo le cui acque sarebbero state rese di nuovo potabili da San Bernardino da Siena.

Da visitare sono la cappella della Madonna, la cappella di San Bernardino, l’antica sacrestia, l’oratorio di San Francesco, oltre al suggestivo itinerario esterno.